作物育种基地选址在吉林农业大学校园内及周边教学科研基地，东至长春市农博园，南至飞虹路南侧，西至生态大街 — 和美路，北至南三环路。按照“路相连、渠相通、旱能灌、涝能排、网覆盖”的建设标准，谋划建设作物育种核心区，主要包括主粮作物育种区、长白山特色经济作物育种区、园艺作物育种区、林木育种区、育种作业区、智慧农业示范区等区域，共占地239公顷。
